RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FAM84AQ96KN4 292 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PALD1Q9ULE6 856 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HPSEQ9Y251 543 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 IPPQ9Y573 584 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 HM13Q8TCT9 377 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TMCO6Q96DC7 493 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ELP3Q9H9T3 547 aa5.06□□□□□ -1.6
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