RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325083.12

PCM1-201, Transcript of pericentriolar material 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 6,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1-201ENST00000325083 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 SERPINB12Q96P63 405 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NLRP1Q9C000 1473 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NR6A1Q15406 480 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 DOK6Q6PKX4 331 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 USP38Q8NB14 1042 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CCDC126Q96EE4 140 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 PDP2Q9P2J9 529 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ZNF839A8K0R7 811 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CBX4O00257 560 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CYB561D2O14569 222 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ACADSP16219 412 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 YME1L1Q96TA2 773 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 FBXO10Q9UK96 956 aa14.51□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MTSS1O43312 755 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MYL4P12829 197 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MIIPQ5JXC2 388 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 PSMD11O00231 422 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RHOCP08134 193 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.093e-6■■■□□ 15.7
PCM1-201ENST00000325083 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CACUL1Q86Y37 369 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 UCMAQ8WVF2 138 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CHKBQ9Y259 395 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 LAMC1P11047 1609 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CCDC154A6NI56 674 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 VAV1P15498 845 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 PPP2R1BP30154 601 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 KCNMA1Q12791 1236 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CYLDQ9NQC7 956 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 A0A1B0GTH6 734 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 AP3D1O14617 1153 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MYL12AP19105 171 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RHBGQ9H310 441 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 FDX1P10109 184 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CUL2Q13617 745 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NR1I3Q14994 352 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ACOX1Q15067 660 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RASA2Q15283 850 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 STK39Q9UEW8 545 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ATP7BP35670 1465 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.5□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CRTAMO95727 393 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RPN2P04844 631 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 TSPAN19P0C672 248 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 BBS4Q96RK4 519 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ATP9AO75110 1047 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MFN2O95140 757 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 FGFR3P22607 806 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RHOAP61586 193 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NLNQ9BYT8 704 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 FLT1P17948 1338 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 IDH3BO43837 385 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 NDUFA5Q16718 116 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 RNF180Q86T96 592 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 VPS33AQ96AX1 596 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 HACL1Q9UJ83 578 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 SLC12A8A0AV02 714 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 BCL10O95999 233 aa14.49□□□□□ -0.09
PCM1-201ENST00000325083 CLPTM1O96005 669 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms