RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227503.13

SF1-201, Transcript of splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF1, Length 2,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1-201ENST00000227503 GMPRP36959 345 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 NOMO3P69849 1222 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CYTH1Q15438 398 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 WDR44Q5JSH3 913 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RMI1Q9H9A7 625 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CDH22Q9UJ99 828 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 H3BNX3 289 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 VWA5AO00534 786 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CCND2P30279 289 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ALDH1A3P47895 512 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SNAPC2Q13487 334 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ACTL9Q8TC94 416 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 TEPSINQ96N21 525 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ARID2Q68CP9 1835 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PDGFRBP09619 1106 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 TNNI1P19237 187 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 OGDHQ02218 1023 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 MTA1Q13330 715 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 LIN9Q5TKA1 542 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 C16orf46Q6P387 395 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RNF148Q8N7C7 305 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 E2F8A0AVK6 867 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 MAFGO15525 162 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CRTAMO95727 393 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ACOT2P49753 483 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 LIG4P49917 911 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CUL2Q13617 745 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CNGA3Q16281 694 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 FAXCQ5TGI0 409 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ATG4CQ96DT6 458 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZNF778Q96MU6 729 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 MCEEQ96PE7 176 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 RNF146Q9NTX7 359 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PSAPP07602 524 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 WEE2P0C1S8 567 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SERPINB8P50452 374 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PRKCEQ02156 737 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-201ENST00000227503 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.088e-7■■■■□ 24.9
SF1-201ENST00000227503 TMEM221A6NGB7 291 aa14.58□□□□□ -0.08
SF1-201ENST00000227503 CD48P09326 243 aa14.58□□□□□ -0.08
SF1-201ENST00000227503 COL6A2P12110 1019 aa14.58□□□□□ -0.08
SF1-201ENST00000227503 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms