RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 DAOAP59103 153 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 LONRF1Q17RB8 773 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SUSD3Q96L08 255 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC25Q96NG3 672 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 NPY6RQ99463 290 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC77Q9BR77 488 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNA2D1P54289 1103 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPY1Q01534 308 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 GUCY1A3Q02108 690 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 DEUP1Q05D60 604 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 NME3Q13232 169 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FZD10Q9ULW2 581 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF24Q9UPV7 400 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 BRCA2P51587 3418 aa24.89■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CEP350Q5VT06 3117 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CFAP69A5D8W1 941 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 SMAPO00193 183 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBED1O96006 694 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 IVLP07476 585 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB41Q5JT25 222 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM171BQ6P995 826 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CPT1BQ92523 772 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5C3BQ969T7 300 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINB12Q96P63 405 aa24.89■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NRP1O14786 923 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNN4O15554 427 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGB1P05556 798 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 USP17L7P0C7H9 530 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 HIF1AQ16665 826 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN26Q16670 478 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.88■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 E7ENQ6 273 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 BDNFP23560 247 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 MFSD5Q6N075 450 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC31Q6UY01 552 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 SELPP16109 830 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 TYMPP19971 482 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NR2C2P49116 596 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL4CP56559 192 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.87■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K6O95382 1288 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 LTFP02788 710 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NCAM1P13591 858 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP5DP30049 168 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM189BP81408 668 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 STAT4Q14765 748 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 PAK5Q9P286 719 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.86■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 HHLA1C9JL84 531 aa24.85■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 F8W810 466 aa24.85■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 ABHD2P08910 425 aa24.85■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 GOT1P17174 413 aa24.85■■□□□ 1.57
RPUSD1-201ENST00000007264 BFSP2Q13515 415 aa24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms