RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000177421.3

Gm20554-201, mousemouse

BASIC

Gene Gm20554, Length 2,352 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Proser1Q5PRE5 913 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Klra8Q60682 266 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Mapk4Q6P5G0 583 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rnf139Q7TMV1 668 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Dusp4Q8BFV3 398 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Arhgap28Q8BN58 729 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Suds3Q8BR65 328 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gpc5Q8CAL5 572 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Klhl2Q8JZP3 593 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ipo11Q8K2V6 975 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Cnot6Q8K3P5 557 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ssx2ipQ8VC66 615 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rhobtb2Q91V93 728 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ces1fQ91WU0 561 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Sntg2Q925E0 539 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Trem1Q9JKE2 230 aa13.16□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 SisF8VQM5 1818 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fam81bA0A140LI28 432 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pik3r2O08908 722 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 IkbkgO88522 412 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Cd3gP11942 182 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Mmp20P57748 482 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rbl2Q64700 1135 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pqlc1Q80XM9 271 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Vmn2r43Q80Z08 845 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rhpn2Q8BWR8 686 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rfx6Q8C7R7 927 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ccdc159Q8C963 411 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Smtnl2Q8CI12 456 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 LzicQ8K3C3 190 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Lypd3Q91YK8 363 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Lysmd3Q99LE3 305 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Thap12Q9CUX1 758 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ppil2Q9D787 521 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Armt1A6H630 439 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Magea1O89006 320 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fgfr2P21803 821 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ptk2P34152 1090 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 LmnaP48678 665 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Hoxc13P50207 328 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 PrkacbP68181 351 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Smyd1P97443 490 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Elf3Q3UPW2 391 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tom1l2Q5SRX1 507 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Dsg1aQ61495 1057 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Map2k2Q63932 401 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Arhgap30Q640N3 1101 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gpd2Q64521 727 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 March4Q80TE3 409 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Siglec10Q80ZE3 688 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Leg1Q8C6C9 337 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Agbl2Q8CDK2 862 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Angel2Q8K1C0 544 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Olfr615Q8VGY4 313 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fam227bQ9D518 532 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Neu2Q9JMH3 379 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Magea2Q9R2A2 320 aa13.15□□□□□ -0.3
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ccdc8D3YZV8 685 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 En1P09065 401 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pou6f1Q07916 301 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Akap14Q3V0I7 536 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Psg28Q4KL66 472 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gpr20Q8BYC4 358 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Wrnip1Q91XU0 660 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 TfQ921I1 697 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pacsin3Q99JB8 424 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Slc39a3Q99K24 317 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tdrd1Q99MV1 1172 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ankef1Q9D2J7 775 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tmco5aQ9D9D5 303 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Mbd1Q9Z2E2 636 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Olfr292F8VQ84 308 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Nptx2O70340 429 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 ZfxP17012 799 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tff2Q03404 129 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 HdxQ14B70 692 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pdlim7Q3TJD7 457 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Cog7Q3UM29 770 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tmprss11eQ5S248 423 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Nr1h2Q60644 446 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 ProcrQ64695 242 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Clec4b1Q7TS58 209 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 TufmQ8BFR5 452 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Slc35c2Q8VCX2 364 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Trim54Q9ERP3 366 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Usp21Q9QZL6 566 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Trpc2Q9R244 1172 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 RecqlQ9Z129 648 aa13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Kcnq2Q9Z351 759 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.3 ms