RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638048.1

RASGEF1B-214, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 2,386 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-214ENST00000638048 RNF208Q9H0X6 261 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 KRT82Q9NSB4 513 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 GPR182O15218 404 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 INPPL1O15357 1258 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 CCDC22O60826 627 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 T-ENOLP0DO92 83 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 CDK4P11802 303 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 PON1P27169 355 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ACADVLP49748 655 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 COG7P83436 770 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 PPP3CAQ08209 521 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 BFSP2Q13515 415 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 DSC3Q14574 896 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 INAQ16352 499 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 HGSNATQ68CP4 663 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 PEX26Q7Z412 305 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 FNDC8Q8TC99 324 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 BAP1Q92560 729 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 DEFB118Q96PH6 123 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 FNBP1Q96RU3 617 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ECSITQ9BQ95 431 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 SIX2Q9NPC8 291 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 PARP2Q9UGN5 583 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-214ENST00000638048 RIPK2O43353 540 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZNF623O75123 536 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 NOL4O94818 638 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 CHRNA1P02708 482 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 BRAFP15056 766 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 FGFR4P22455 802 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 NFKBIAP25963 317 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 ARFIP2P53365 341 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 IL9RQ01113 521 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 GCNT1Q02742 428 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 MED21Q13503 144 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 ADRM1Q16186 407 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 PTPROQ16827 1216 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 DUPD1Q68J44 220 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 VSTM1Q6UX27 236 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 ACAD11Q709F0 780 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 TREML1Q86YW5 311 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 GAB3Q8WWW8 586 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 CASP10Q92851 521 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 WNT8BQ93098 351 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 GCNT4Q9P109 453 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 FAM187AA6NFU0 413 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 A8MXQ7 604 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 NDC80O14777 642 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 GYG2O15488 501 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 CBFA2T3O75081 653 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 TRIM49P0CI25 452 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 TRIM49CP0CI26 452 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 STAG3L1P0CL83 205 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 CPA3P15088 417 aa6.95□□□□□ -1.3
RASGEF1B-214ENST00000638048 KCNE1P15382 129 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms