RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 ZIM3Q96PE6 472 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 GNA15P30679 374 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 NOMO3P69849 1222 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 DR1Q01658 176 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 GPR17Q13304 367 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 CXorf38Q8TB03 319 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 MAFFQ9ULX9 164 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-210ENST00000619438 SEC24AO95486 1093 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PTP4A2Q12974 167 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 NAA35Q5VZE5 725 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DUPD1Q68J44 220 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM270Q6UE05 265 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PRELID2Q8N945 189 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ERP44Q9BS26 406 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CLUHO75153 1309 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DAPK3O43293 454 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PYGMP11217 842 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 BTBD6Q96KE9 485 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM209Q96SK2 561 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SCN1AP35498 2009 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAM170AA1A519 330 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DCXO43602 365 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PAPLNO95428 1278 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 RRM1P23921 792 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GBP1P32455 592 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LMAN1P49257 510 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DUSP4Q13115 394 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR3Q13615 1198 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ELMOD1Q8N336 334 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CALCAP01258 141 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FSHRP23945 695 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PTGIRP43119 386 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZMYND15Q9H091 742 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.21e-7■■■□□ 14.9
SGMS1-210ENST00000619438 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SCINQ9Y6U3 715 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 MYO1FO00160 1098 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN2P17706 415 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 CDR1P51861 262 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 NTHL1P78549 312 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TSPY1Q01534 308 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 AADACL2Q6P093 401 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DPH6Q7L8W6 267 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 JAMLQ86YT9 394 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 PROSCO94903 275 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 ALDH1A3P47895 512 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 LHX1P48742 406 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 FNTAP49354 379 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 TWF1Q12792 350 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-210ENST00000619438 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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