RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612720.1

HULC.1-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene HULC, Length 240 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC.1-201ENST00000612720 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.8□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 A8MVJ9 347 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 RFPL1O75677 317 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 IL1R1P14778 569 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 SCP2P22307 547 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 GATMP50440 423 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 GPC5P78333 572 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 MTX1Q13505 466 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 APOA5Q6Q788 366 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 USP49Q70CQ1 688 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 SUCLG2Q96I99 432 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 LYZL4Q96KX0 146 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 FZD4Q9ULV1 537 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.79□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 FRS3O43559 492 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 MTHFSP49914 203 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 PGDP52209 483 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 HSF1Q00613 529 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 ERV3-1Q14264 604 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 HIC2Q96JB3 615 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 TRMOQ9BU70 441 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 DKK4Q9UBT3 224 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 VPS51Q9UID3 782 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 L1RE1Q9UN81 338 aa4.78□□□□□ -1.64
HULC.1-201ENST00000612720 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CAPN8A6NHC0 703 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 ISM1B1AKI9 464 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 RGS10O43665 173 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 ARHGEF7Q14155 803 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 TM2D2Q9BX73 214 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 COL20A1Q9P218 1284 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 MAFFQ9ULX9 164 aa4.77□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 B4DGG1 531 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 H3BNX3 289 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 RRHO14718 337 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 FYB1O15117 783 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 PRAMEF2O60811 474 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 TULP3O75386 442 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 PIAS2O75928 621 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 PDGFRBP09619 1106 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 ADRA1DP25100 572 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 ITGA8P53708 1063 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 MMP21Q8N119 569 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 SQORQ9Y6N5 450 aa4.76□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 A6NNZ2 444 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 ACVR2AP27037 513 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 NTSR1P30989 418 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 HTR7P34969 479 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 COPAP53621 1224 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 FHL3Q13643 280 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 PIM3Q86V86 326 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 STK31Q9BXU1 1019 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CHST8Q9H2A9 424 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 NOTCH4Q99466 2003 aa4.75□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.74□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 FAM227AF5H4B4 570 aa4.74□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 RASSF9O75901 435 aa4.74□□□□□ -1.65
HULC.1-201ENST00000612720 CD19P15391 556 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms