RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC35C1Q96A29 364 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP63Q96MT8 703 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 NT5C1BQ96P26 610 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 HHIPQ96QV1 700 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TBX18O95935 607 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 HMBSP08397 361 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ADH5P11766 374 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TCF3P15923 654 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 BMP6P22004 513 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CETN1Q12798 172 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DHCR24Q15392 516 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ANO4Q32M45 955 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MIB1Q86YT6 1006 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 NAT16Q8N8M0 369 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RUBCNQ92622 972 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DUSP16Q9BY84 665 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 NMUR1Q9HB89 426 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 COMMD8Q9NX08 183 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 HESX1Q9UBX0 185 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SCML2Q9UQR0 700 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 E2F8A0AVK6 867 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 HHLA1C9JL84 531 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 K7ESF4 209 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE2BO14633 110 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ATG13O75143 517 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RALAP11233 206 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TDGF1P13385 188 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RARGP13631 454 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 OPRD1P41143 372 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TUBP50607 506 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO43Q4G163 708 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SGO2Q562F6 1265 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 C2orf27AQ580R0 203 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM270Q6UE05 265 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 C12orf40Q86WS4 652 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 BHMTQ93088 406 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 WBP2Q969T9 261 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ACDQ96AP0 544 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 EPC1Q9H2F5 836 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 OSER1Q9NX31 292 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 USP18Q9UMW8 372 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM92AA1XBS5 289 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 LILRB5O75023 590 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CALCAP01258 141 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 APODP05090 189 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC192P0DO97 292 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT5P13647 590 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC6A11P48066 632 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TKTL1P51854 596 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF11P52732 1056 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 BCAT1P54687 386 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 EFEMP1Q12805 493 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DMC1Q14565 340 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RRAGAQ7L523 313 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGZQ86VD9 579 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 LONP2Q86WA8 852 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 UBA3Q8TBC4 463 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KAT5Q92993 513 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms