RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 SLC6A3Q01959 620 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 PLCB3Q01970 1234 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 GUCY2DQ02846 1103 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ADCY1Q08828 1119 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ACAP1Q15027 740 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CCDC14Q49A88 953 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 FAM171BQ6P995 826 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 BNIPLQ7Z465 357 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 IFT20Q8IY31 132 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 RAPGEF5Q92565 580 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DPF3Q92784 378 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CAVIN3Q969G5 261 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 TNIP3Q96KP6 325 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SUSD3Q96L08 255 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 HSFY1Q96LI6 401 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 UROC1Q96N76 676 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 PEBP4Q96S96 227 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CNPY3Q9BT09 278 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DUSP16Q9BY84 665 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DCLK3Q9C098 648 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MIS12Q9H081 205 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 PTPRDP23468 1912 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 TTLL8A6PVC2 850 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 I3L4J1 428 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 PIK3R2O00459 728 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 TP73O15350 636 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ERLIN1O75477 346 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 AP1G2O75843 785 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 FAM153BP0C7A2 387 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 NPR3P17342 541 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 TYMPP19971 482 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 GPD1P21695 349 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 IVDP26440 423 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ADORA2BP29275 332 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MIPP30301 263 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 PTPN9P43378 593 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 BRCC3P46736 316 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 LHX1P48742 406 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CACNA2D1P54289 1103 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 FAAP100Q0VG06 881 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 BFSP2Q13515 415 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CASP8Q14790 479 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 FAM153CQ494X1 144 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 TRIM60Q495X7 471 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 RAB41Q5JT25 222 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 PIGZQ86VD9 579 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 JAMLQ86YT9 394 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 MREGQ8N565 214 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 RNF169Q8NCN4 708 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPN3-210ENST00000561817 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms