RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCF25Q9BQ70 676 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.79□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCER2I3L3R5 266 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA12O60330 932 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMMRO75330 724 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPY3P0CV98 308 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPY8P0CW00 308 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNAT2P19087 354 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCCP23508 829 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 TDO2P48775 406 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXL1Q12952 345 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTGISQ16647 500 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR156Q8NFN8 814 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCFD2Q8WU76 684 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 JADE3Q92613 823 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKS1AQ92625 1134 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 KAT2BQ92831 832 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAD9AQ99638 391 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLR9Q9NR96 1032 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCDNQ9UBB6 729 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.78□□□□□ -0.84
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHL33A6NCF5 533 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMP3P08254 477 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 CKBP12277 381 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 COMTP21964 271 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPEPPSP55786 919 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFAP4Q01664 338 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGAP1Q07960 439 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPN21Q16825 1174 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.77□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 NMT2O60551 498 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF2O75151 1096 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDGFRBP09619 1106 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00271P0C7V0 271 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 GYPEP15421 78 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUSP2Q05923 314 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8orf49Q96NF6 230 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 STX8Q9UNK0 236 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 HAS3O00219 553 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNHG28P0DPA3 235 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXC8P31273 242 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 CASRP41180 1078 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP3CAQ08209 521 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 MST1LQ2TV78 715 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATS1Q496A3 300 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZSN1 163 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS33Q8NF86 280 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF480Q8WV37 535 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 AFG1LQ8WV93 481 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-204ENST00000559861 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms