RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555626.5

PAPOLA-215, Transcript of poly(A) polymerase alpha, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPOLA, Length 2,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLA-215ENST00000555626 KIFC3Q9BVG8 833 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SGPP1Q9BX95 441 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CD244Q9BZW8 370 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 KATNBL1Q9H079 304 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 VTA1Q9NP79 307 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 OLFML3Q9NRN5 406 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SLC5A4Q9NY91 659 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 DTLQ9NZJ0 730 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 FLRT1Q9NZU1 646 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SEL1LQ9UBV2 794 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 NCOR1O75376 2440 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TISP43B9A030 160 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PDXKO00764 312 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CETN3O15182 167 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TGFB1I1O43294 461 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TSPAN15O95858 294 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 GH1P01241 217 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 NR3C1P04150 777 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TPM2P07951 284 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 NCAM1P13591 858 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ATF2P15336 505 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SYN1P17600 705 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 NR2F2P24468 414 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 MSNP26038 577 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CASP4P49662 377 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 KLK7P49862 253 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TNFAIP2Q03169 654 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PIK3R6Q5UE93 754 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 FSTL4Q6MZW2 842 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 KIF18BQ86Y91 864 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 AHI1Q8N157 1196 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 OR6J1Q8NGC5 347 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ZBTB10Q96DT7 871 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 C11orf49Q9H6J7 331 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CD320Q9NPF0 282 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 KMT5AQ9NQR1 393 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 GJD2Q9UKL4 321 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 DENND3A2RUS2 1198 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LGALS16A8MUM7 142 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ADCY6O43306 1168 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LTFP02788 710 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ZNF286BP0CG31 522 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 KRT15P19012 456 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PBX1P40424 430 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 RGS2P41220 211 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 NPTX2P47972 431 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 FLT3LGP49771 235 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CYP2J2P51589 502 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 GSDMDP57764 484 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 DRP2Q13474 957 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 EMC2Q15006 297 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PLCB4Q15147 1175 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 CR1LQ2VPA4 569 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 VWA3BQ502W6 1294 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 MIIPQ5JXC2 388 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 USP6NLQ92738 828 aa3.99□□□□□ -1.77
PAPOLA-215ENST00000555626 KIFAP3Q92845 792 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms