RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF286BP0CG31 522 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC9A1P19634 815 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FGFR2P21802 821 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NEK2P51955 445 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA8P53708 1063 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC153Q494R4 210 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SERAC1Q96JX3 654 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ASB2Q96Q27 587 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM237Q96Q45 408 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 A0A088AWK7 358 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CYTH3O43739 400 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NAB1Q13506 487 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 WLSQ5T9L3 541 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STK40Q8N2I9 435 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 IDI2Q9BXS1 227 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VPS51Q9UID3 782 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VPS28Q9UK41 221 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2C18P33260 490 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRKAA1Q13131 559 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK7Q13164 816 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RPAINQ86UA6 219 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RIN3Q8TB24 985 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 E2F7Q96AV8 911 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EVPLQ92817 2033 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CACNA1SQ13698 1873 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MGAT4DA6NG13 374 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AKAP10O43572 662 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TPBGLP0DKB5 382 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HPGDP15428 266 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 YY1P25490 414 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PPP2R1BP30154 601 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PEX19P40855 299 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TBX4P57082 545 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMED1Q13445 227 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMC7Q7Z402 723 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PLD3Q8IV08 490 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SOX13Q9UN79 622 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 COL1A2P08123 1366 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM114B3SHH9 223 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FOXN1O15353 648 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VPS4BO75351 444 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINF2P08697 491 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CHN1P15882 459 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CRABP2P29373 138 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ANTXR2P58335 489 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MYL6P60660 151 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCB1Q12824 385 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GRTP1Q5TC63 336 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC5A5Q92911 643 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MYPNQ86TC9 1320 aa6.59□□□□□ -1.35
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