RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PMLP29590 882 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ABCD1P33897 745 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RAP1GAPP47736 663 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SOX9P48436 509 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MCM2P49736 904 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RUNX3Q13761 415 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 Q6ZS52 159 aa8.29□□□□□ -1.08
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C16orf62-212ENST00000540240 METTL23Q86XA0 190 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 KCNN1Q92952 543 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 BICD1Q96G01 975 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 VPS45Q9NRW7 570 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GKN1Q9NS71 199 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 NCANO14594 1321 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF292O60281 2723 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LACTBL1A8MY62 500 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 OGTO15294 1046 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SLC26A4O43511 780 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RHOBTB1O94844 696 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CXCL8P10145 99 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CDC25AP30304 524 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 AVPR1AP37288 418 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SERPINB4P48594 390 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LIG4P49917 911 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 OXCT1P55809 520 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LILRA4P59901 499 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 FBXO43Q4G163 708 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SEZ6Q53EL9 994 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 HYIQ5T013 277 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 STPG1Q5TH74 334 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SPATA1Q5VX52 437 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TTC8Q8TAM2 541 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SENP8Q96LD8 212 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DERAQ9Y315 318 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CITO14578 2027 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DMDP11532 3685 aa8.28□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DBX1A6NMT0 343 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 PIRO00625 290 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 EXTL3O43909 919 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 KCNK5O95279 499 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 PIGRP01833 764 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 SLFN14P0C7P3 912 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 DRD1P21728 446 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 NCKAP1LP55160 1127 aa8.27□□□□□ -1.09
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C16orf62-212ENST00000540240 SPAG1Q07617 926 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 BFSP1Q12934 665 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 PDGFRLQ15198 375 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 ELF2Q15723 593 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 C11orf74Q86VG3 221 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 FAM129BQ96TA1 746 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 ASB7Q9H672 318 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 TDP1Q9NUW8 608 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.27□□□□□ -1.09
C16orf62-212ENST00000540240 KIF3AQ9Y496 699 aa8.27□□□□□ -1.09
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