RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 TOM1O60784 492 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PEX14O75381 377 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MYO1DO94832 1006 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 BAG2O95816 211 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GH1P01241 217 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FGGP02679 453 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 UGT2B4P06133 528 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GLULP15104 373 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TSHRP16473 764 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GAP43P17677 238 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KRT15P19012 456 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RPA1P27694 616 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TALDO1P37837 337 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ANTXR2P58335 489 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SSTP61278 116 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PHC1P78364 1004 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB16Q05516 673 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TEFQ10587 303 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CETN1Q12798 172 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ACAP2Q15057 778 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DOK7Q18PE1 504 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 C4orf46Q504U0 113 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 C12orf60Q5U649 245 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ATG16L1Q676U5 607 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CORO6Q6QEF8 472 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RANBP10Q6VN20 620 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CARM1Q86X55 608 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 AADATQ8N5Z0 425 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PAF1Q8N7H5 531 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CERKQ8TCT0 537 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MGARPQ8TDB4 240 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RFFLQ8WZ73 363 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 HPS1Q92902 700 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CDCA5Q96FF9 252 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CEP95Q96GE4 821 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MAGED4Q96JG8 741 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 OPALINQ96PE5 141 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 EMC3Q9P0I2 261 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 HEY2Q9UBP5 337 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MYH11P35749 1972 aa6.35□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RTL9Q8NET4 1388 aa6.34□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.34□□□□□ -1.39
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