RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 COMMD8Q9NX08 183 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TCF3P15923 654 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 CXCL12P48061 93 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 BCAT1P54687 386 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 C2orf27AQ580R0 203 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 EMC10Q5UCC4 262 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PMF1Q6P1K2 205 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM25Q86YD3 366 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TTC39CQ8N584 583 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 P2RY11Q96G91 374 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 HHIPQ96QV1 700 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MIS12Q9H081 205 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PLK2Q9NYY3 685 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 USP3Q9Y6I4 520 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 EML5Q05BV3 1969 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PMM2O15305 246 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 P4HA2O15460 535 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 ADH5P11766 374 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TDGF1P13385 188 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MAGEA9P43362 315 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 NR1H3Q13133 447 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 RAB41Q5JT25 222 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MSANTD3Q96H12 275 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC12A8A0AV02 714 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 E2F8A0AVK6 867 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 BECN2A8MW95 431 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 KCNJ18B7U540 433 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 E7ENQ6 273 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 K7ESF4 209 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 GREM1O60565 184 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 ZBED1O96006 694 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PFKLP17858 780 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PON1P27169 355 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 CCR3P51677 355 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF132P52740 706 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 KCNJ12Q14500 433 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PKDCCQ504Y2 493 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MIIPQ5JXC2 388 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 GBP6Q6ZN66 633 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PASD1Q8IV76 773 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 HINFPQ9BQA5 517 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 THAP9Q9H5L6 903 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SIX2Q9NPC8 291 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 CYLDQ9NQC7 956 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 ST7Q9NRC1 585 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PROB1E7EW31 1015 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 K7EQS6 105 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 THAP12O43422 761 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 STC2O76061 302 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 KLKB1P03952 638 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PAEPP09466 180 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 RALAP11233 206 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TIE1P35590 1138 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 KLK7P49862 253 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TUBP50607 506 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC8A3P57103 927 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 GCNT1Q02742 428 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 MAN2A1Q16706 1144 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD42-209ENST00000533342 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms