RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 GCNT4Q9P109 453 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CEP72Q9P209 647 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CDH22Q9UJ99 828 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 DSEQ9UL01 958 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MYO10Q9HD67 2058 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SMTNL1A8MU46 457 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 HHLA1C9JL84 531 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 F8W735 103 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 RFPL2O75678 378 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CALCAP01258 141 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 POU2F2P09086 479 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SPATA31D3P0C874 917 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ATF2P15336 505 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ATF6P18850 670 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 LHX1P48742 406 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CDR1P51861 262 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 NDST1P52848 882 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 FANCCQ00597 558 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 LRMPQ12912 555 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ORC1Q13415 861 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SYCP1Q15431 976 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PTPN21Q16825 1174 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 TPGS2Q68CL5 300 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 IQCEQ6IPM2 695 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 GBP6Q6ZN66 633 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 Q6ZS46 218 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 RRAGAQ7L523 313 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 UNC93AQ86WB7 457 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PALB2Q86YC2 1186 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 FUKQ8N0W3 1084 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 C12orf29Q8N999 325 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 TFAP2BQ92481 460 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PCED1BQ96HM7 432 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 NT5C1BQ96P26 610 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SYT15Q9BQS2 421 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SYT11Q9BT88 431 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MUC3BQ9H195 1237 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 VPS16Q9H269 839 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ABCB6Q9NP58 842 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CISHQ9NSE2 258 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CDH9Q9ULB4 789 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MAFFQ9ULX9 164 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 FHOD1Q9Y613 1164 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 A0A1W2PQC6 194 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CLDN5O00501 218 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 EREGO14944 169 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 NDUFB5O43674 189 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 MOSPD3O75425 235 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 SOAT2O75908 522 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 BEST1O76090 585 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ALX3O95076 343 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 GLUD1P00367 558 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PDGFRBP09619 1106 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CCDC130P13994 396 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 ACPPP15309 386 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 UCHL3P15374 230 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 CYP2F1P24903 491 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 KLRC2P26717 231 aa5.74□□□□□ -1.49
MSRA-208ENST00000522907 PCSK1P29120 753 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms