RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	AREL1	O15033	823 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	KIF3B	O15066	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	MOSPD3	O75425	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	RNF8	O76064	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	COPA	P53621	1224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402		E5RJQ4	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402		F8W8V4	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	AGPS	O00116	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	DSCR3	O14972	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	MCM5	P33992	734 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	MMP13	P45452	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-223	ENST00000514402	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	DGKQ	P52824	942 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	KCNB1	Q14721	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SARG	Q9BW04	601 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	KCNQ3	O43525	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	MYL4	P12829	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SLC5A2	P31639	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	HTR7	P34969	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	CASP5	P51878	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	CUL5	Q93034	780 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	FCHO1	O14526	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PPEF2	O14830	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	TP73	O15350	636 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	WDR47	O94967	919 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM27	P14373	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	PLCD1	P51178	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	GPC5	P78333	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	GHRHR	Q02643	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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