RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511355.5

NME1-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-209ENST00000511355 C2CD2Q9Y426 696 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 HES2Q9Y543 173 aa14.63□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 PTPRJQ12913 1337 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CITO14578 2027 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 IL1BP01584 269 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 FGBP02675 491 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CYP2C18P33260 490 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ARSEP51690 589 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CCL23P55773 120 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MPP2Q14168 576 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CRYMQ14894 314 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CYP4X1Q8N118 509 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SCLYQ96I15 445 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MIS12Q9H081 205 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SAR1AQ9NR31 198 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CNTN3Q9P232 1028 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DERAQ9Y315 318 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.62□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 LACTBL1A8MY62 500 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ATP2C2O75185 946 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 KRT1P04264 644 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DNAJB2P25686 324 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CDKN2BP42772 138 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MSH2P43246 934 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ARL4CP56559 192 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 LRRC14Q15048 493 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 RAB30Q15771 203 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 XKR4Q5GH76 650 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 RASIP1Q5U651 963 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 BBS12Q6ZW61 710 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 VSIG1Q86XK7 387 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CEP57Q86XR8 500 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TTC39CQ8N584 583 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 FITM2Q8N6M3 262 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 HERVK_113Q902F9 699 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 VPS11Q9H270 941 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TRABDQ9H4I3 376 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.61□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 C9IYK1 514 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TYROBPO43914 113 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TNNC2P02585 160 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 PFKMP08237 780 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 NFICP08651 508 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 FOSL2P15408 326 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 GCAP28676 217 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ERICH1Q86X53 443 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MGARPQ8TDB4 240 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 TIFAQ96CG3 184 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 PGBD4Q96DM1 585 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 C9orf72Q96LT7 481 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 APOL6Q9BWW8 343 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 MSRAQ9UJ68 235 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 SCN5AQ14524 2016 aa14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NME1-209ENST00000511355 ACRP10323 421 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms