RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 FKBP10Q96AY3 582 aa4.86□□□□□ -1.63
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TIMMDC1-209ENST00000498399 SNX22Q96L94 193 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa4.86□□□□□ -1.63
TIMMDC1-209ENST00000498399 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.86□□□□□ -1.63
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TIMMDC1-209ENST00000498399 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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TIMMDC1-209ENST00000498399 PLA1AQ53H76 456 aa4.84□□□□□ -1.63
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TIMMDC1-209ENST00000498399 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.632e-6■□□□□ 9.3
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TIMMDC1-209ENST00000498399 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.84□□□□□ -1.63
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TIMMDC1-209ENST00000498399 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.84□□□□□ -1.63
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TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1W2PPC4 97 aa4.83□□□□□ -1.64
TIMMDC1-209ENST00000498399 F5H423 210 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TIMMDC1-209ENST00000498399 DCLK1O15075 740 aa4.83□□□□□ -1.64
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOAT2O75908 522 aa4.83□□□□□ -1.64
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGF18O76093 207 aa4.83□□□□□ -1.64
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTLL1O95922 423 aa4.83□□□□□ -1.64
TIMMDC1-209ENST00000498399 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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