RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.4	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	RRH	O14718	337 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CA12	O43570	354 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	INSC	Q1MX18	579 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PIM3	Q86V86	326 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	RASSF9	O75901	435 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CPA2	P48052	419 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	STK3	Q13188	491 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	FHL3	Q13643	280 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MMP21	Q8N119	569 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.38	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	RAB27B	O00194	218 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PIAS2	O75928	621 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MTHFS	P49914	203 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CCP110	O43303	1012 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TULP3	O75386	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	IL1R1	P14778	569 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PPC1	479 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268		A6NNZ2	444 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268		A8MVJ9	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP34-222	ENST00000498268	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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