RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-209ENST00000486016 ARHGEF7Q14155 803 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 KCNB1Q14721 858 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 MIDNQ504T8 468 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 DENND2CQ68D51 928 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ANO7Q6IWH7 933 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 USP49Q70CQ1 688 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 COL20A1Q9P218 1284 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 VPS51Q9UID3 782 aa4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 RGS10O43665 173 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 TNFRSF1BP20333 461 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 PGDP52209 483 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 YPEL5P62699 121 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 VSTM1Q6UX27 236 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 FZD4Q9ULV1 537 aa4.79□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 A6NNZ2 444 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 PSG1P11464 419 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 MTHFSP49914 203 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 FMO1Q01740 532 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 FHL3Q13643 280 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CNGA2Q16280 664 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CHST8Q9H2A9 424 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 POT1Q9NUX5 634 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GCFC2-209ENST00000486016 FAM227AF5H4B4 570 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 PIAS2O75928 621 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 ME1P48163 572 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 COPAP53621 1224 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 ITGA8P53708 1063 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 EPHB1P54762 984 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 HSF1Q00613 529 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 MTX1Q13505 466 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 PELI3Q8N2H9 469 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 HIC2Q96JB3 615 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 TRMOQ9BU70 441 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 STK31Q9BXU1 1019 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 MAFFQ9ULX9 164 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.77□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 RRHO14718 337 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 FYB1O15117 783 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 PRAMEF2O60811 474 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 RASSF9O75901 435 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 ADRA1DP25100 572 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 ACVR2AP27037 513 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 NTSR1P30989 418 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 HTR7P34969 479 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 CPT1AP50416 773 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 SLC29A2Q14542 456 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 P2RY11Q96G91 374 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 ZDHHC12Q96GR4 267 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 LYZL4Q96KX0 146 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 TM2D2Q9BX73 214 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 MID2Q9UJV3 735 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 COL15A1P39059 1388 aa4.76□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 CFAP69A5D8W1 941 aa4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 BRAFP15056 766 aa4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 CD19P15391 556 aa4.75□□□□□ -1.65
GCFC2-209ENST00000486016 SCP2P22307 547 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 248.7 ms