RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480226.5

ITGB1-212, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-212ENST00000480226 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TTC17Q96AE7 1141 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SNX15Q9NRS6 342 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 DKK4Q9UBT3 224 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 MYMKA6NI61 221 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TRIM38O00635 465 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 KIF3BO15066 747 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CCP110O43303 1012 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RGS10O43665 173 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 NTN1O95631 604 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TRIM27P14373 513 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ITGA8P53708 1063 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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ITGB1-212ENST00000480226 LMAN2Q12907 356 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ARHGEF7Q14155 803 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TMEM65Q6PI78 240 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SHC4Q6S5L8 630 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RNF152Q8N8N0 203 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ZNF398Q8TD17 642 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 COQ8BQ96D53 544 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SNX22Q96L94 193 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 WACQ9BTA9 647 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.07□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 A0A087WZ62 844 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RAB27BO00194 218 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SRGAP2O75044 1071 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RASAL1O95294 804 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 HGFP14210 728 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CREB1P16220 341 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ACVR2AP27037 513 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 UQCRC1P31930 480 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CASP5P51878 434 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 KRTAP10-9P60411 292 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 FHL3Q13643 280 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.06□□□□□ -1.6
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ITGB1-212ENST00000480226 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 KPNA5O15131 536 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PMM2O15305 246 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 INSIG1O15503 277 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SNHG28P0DPA3 235 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 CPT1AP50416 773 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TIRAPP58753 221 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 DAG1Q14118 895 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SLC29A2Q14542 456 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 KCNAB1Q14722 419 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TWIST1Q15672 202 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 MAFFQ9ULX9 164 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TMPRSS11DO60235 418 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 IL18RAPO95256 599 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 TSHRP16473 764 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PRIM2P49643 509 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 DIO1P49895 249 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 ANO7Q6IWH7 933 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 NRACQ8N912 160 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PJA1Q8NG27 643 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB1-212ENST00000480226 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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