RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
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C9orf3-215ENST00000478473 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 PLA2G4AP47712 749 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF132P52740 706 aa24.64■■□□□ 1.54
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C9orf3-215ENST00000478473 LRMPQ12912 555 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGAP18Q8N392 663 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 USP33Q8TEY7 942 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-215ENST00000478473 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.64■■□□□ 1.54
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C9orf3-215ENST00000478473 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.64■■□□□ 1.54
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C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.63■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.63■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 NAGPAQ9UK23 515 aa24.63■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 C12orf40Q86WS4 652 aa24.62■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.62■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 HESX1Q9UBX0 185 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 EBF1Q9UH73 591 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.62■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 KAT7O95251 611 aa24.6■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 ZBED1O96006 694 aa24.6■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 LAIR1Q6GTX8 287 aa24.6■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.6■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.59■■□□□ 1.53
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C9orf3-215ENST00000478473 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 MEA1Q16626 185 aa24.58■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 RRAGAQ7L523 313 aa24.58■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 GAB3Q8WWW8 586 aa24.58■■□□□ 1.53
C9orf3-215ENST00000478473 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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