RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 GUCY2CP25092 1073 aa8.4□□□□□ -1.06
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SZRD1-208ENST00000476423 NTSR1P30989 418 aa8.4□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 CLCN6P51797 869 aa8.4□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB6Q15916 424 aa8.4□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00303Q3SY05 128 aa8.4□□□□□ -1.06
SZRD1-208ENST00000476423 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.4□□□□□ -1.06
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SZRD1-208ENST00000476423 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.4□□□□□ -1.06
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SZRD1-208ENST00000476423 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 NCKAP1LP55160 1127 aa8.39□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 NLRP12P59046 1061 aa8.39□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 CLTAP09496 248 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 TRAPPC10P48553 1259 aa8.38□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 KRT79Q5XKE5 535 aa8.38□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.38□□□□□ -1.07
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SZRD1-208ENST00000476423 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SLC22A12Q96S37 553 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 FIZ1Q96SL8 496 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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