RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 C18orf8Q96DM3 657 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CPQQ9Y646 472 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CAPN9O14815 690 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 AP5Z1O43299 807 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 DRC7Q8IY82 874 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC22A12Q96S37 553 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 OSER1Q9NX31 292 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 ERBB2P04626 1255 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 GLI1P08151 1106 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 TCF3P15923 654 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 PFKPQ01813 784 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CENPCQ03188 943 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 POTEHQ6S545 545 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 VITQ6UXI7 678 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF38Q9H0F5 515 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 BRD9Q9H8M2 597 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CD320Q9NPF0 282 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF263O14978 683 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 HSF2BPO75031 334 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 MFAP3LO75121 409 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 GABBR2O75899 941 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CALB1P05937 261 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 SRFP11831 508 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 ALADP13716 330 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 GABRB2P47870 512 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 EFEMP1Q12805 493 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 USP4Q13107 963 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 GRM2Q14416 872 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 BEND5Q7L4P6 421 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 EDEM1Q92611 657 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 CCL26Q9Y258 94 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-212ENST00000472427 TNFRSF10AO00220 468 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 LEFTY2O00292 366 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 DCXO43602 365 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 SKILP12757 684 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 NCAM1P13591 858 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 MMP8P22894 467 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 GDI1P31150 447 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 SCNN1AP37088 669 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 PGFP49763 221 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 COG7P83436 770 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC6A3Q01959 620 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 MTF1Q14872 753 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF77Q15935 545 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 MIB1Q86YT6 1006 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 IRF7Q92985 503 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAJC7Q99615 494 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 DEF6Q9H4E7 631 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 CHADO15335 359 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 TBX18O95935 607 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 IFNAR2P48551 515 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-212ENST00000472427 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms