RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP1-207ENST00000471650 PRRG1O14668 218 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM66O15016 1216 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 ZMYND10O75800 440 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 BEST1O76090 585 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 SERPING1P05155 500 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 WDR59Q6PJI9 974 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 SHDQ96IW2 340 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 SYT11Q9BT88 431 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 LHX5Q9H2C1 402 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 YIPF1Q9Y548 306 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 F8VP50 259 aa11.32□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 SOAT2O75908 522 aa11.32□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.32□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 PANX2Q96RD6 677 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNK16Q96T55 309 aa11.32□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-207ENST00000471650 MAGEA9P43362 315 aa11.31□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 PLA2G4AP47712 749 aa11.31□□□□□ -0.6
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SH3BP1-207ENST00000471650 EPHB3P54753 998 aa11.31□□□□□ -0.6
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