RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MBLAC2Q68D91 279 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 USP51Q70EK9 711 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM160B2Q86V87 743 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 Q8N1X5 172 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC8Q8TAM2 541 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SDR42E1Q8WUS8 393 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 APOL6Q9BWW8 343 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 BACH2Q9BYV9 841 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KLC2Q9H0B6 622 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CHST12Q9NRB3 414 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GINS2Q9Y248 185 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC171Q6TFL3 1326 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF263O14978 683 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CCL16O15467 120 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TGM5O43548 720 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 FZD7O75084 574 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS6KA5O75582 802 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GJB3O75712 270 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 IDH1O75874 414 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ICAM1P05362 532 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 URODP06132 367 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SERPINF2P08697 491 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 HNF1BP35680 557 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ACVRL1P37023 503 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC6A11P48066 632 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GIPRP48546 466 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 IGBP1P78318 339 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO1EQ12965 1108 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R5EQ16537 467 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 USH1GQ495M9 461 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SLFN13Q68D06 897 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP76Q8TAP6 659 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MSANTD3Q96H12 275 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MENTQ9BUN1 341 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 VPS11Q9H270 941 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DEF6Q9H4E7 631 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPN10Q9HC96 672 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP14Q9HCL3 533 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TRPV5Q9NQA5 729 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 NYAP2Q9P242 653 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PLAAQ9Y263 795 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MYH4Q9Y623 1939 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF224P0DH78 156 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF28P17035 718 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMC3P17980 439 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 FCARP24071 287 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 EPHA5P54756 1037 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM189BP81408 668 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PPFIA1Q13136 1202 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 INF2Q27J81 1249 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00303Q3SY05 128 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MROH9Q5TGP6 573 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 VITQ6UXI7 678 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KCTD1Q719H9 257 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms