RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.27■■□□□ 1.64
PPP1CB-208ENST00000455580 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.27■■□□□ 1.64
PPP1CB-208ENST00000455580 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KAT7O95251 611 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 APODP05090 189 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TTC30AQ86WT1 665 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM25Q86YD3 366 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 LMO3Q8TAP4 145 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 EBF1Q9UH73 591 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SPTBN4Q9H254 2564 aa25.26■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MYOFQ9NZM1 2061 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MDM4O15151 490 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 AXIN1O15169 862 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 P4HA2O15460 535 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 RALAP11233 206 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 GRIA2P42262 883 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TNFRSF4P43489 277 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 STX17P56962 302 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC8A3P57103 927 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 UBE2HP62256 183 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SGO2Q562F6 1265 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.25■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 DCHS1Q96JQ0 3298 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 APBB3O95704 486 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 VDRP11473 427 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SPEM2Q0P670 501 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CETN1Q12798 172 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PAK1Q13153 545 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 NAT16Q8N8M0 369 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 NT5C1BQ96P26 610 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.24■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TULP2O00295 520 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 LRP3O75074 770 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TULP3O75386 442 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 GNA14O95837 355 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CD19P15391 556 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PDE4CQ08493 712 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ANO4Q32M45 955 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 EMC10Q5UCC4 262 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC33Q8N5R6 958 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 DEC1Q9P2X7 70 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 HESX1Q9UBX0 185 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 USP18Q9UMW8 372 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.23■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 DMXL1Q9Y485 3027 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC192P0DO97 292 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TKTL1P51854 596 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 BCAT1P54687 386 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KDSRQ06136 332 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KCNH2Q12809 1159 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 Q6ZNB5 142 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 DLL3Q9NYJ7 618 aa25.22■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 STC2O76061 302 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PAEPP09466 180 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TIE1P35590 1138 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 COG7P83436 770 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP8P85298 464 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CRY1Q16526 586 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 CAMK4Q16566 473 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM270Q6UE05 265 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ERMP1Q7Z2K6 904 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms