RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF699	Q32M78	642 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZACN	Q401N2	412 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	VWA3B	Q502W6	1294 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	FUT10	Q6P4F1	479 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	LUZP1	Q86V48	1076 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	APPL2	Q8NEU8	664 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	POF1B	Q8WVV4	589 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	RABGGTA	Q92696	567 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGSF21	Q96ID5	467 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	HPDL	Q96IR7	371 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED15	Q96RN5	788 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMS19	Q96T76	1030 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CEP41	Q9BYV8	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF576	Q9H609	170 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CIT	O14578	2027 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	COL4A6	Q14031	1691 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTPRJ	Q12913	1337 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANO9	A1A5B4	782 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	KPNA7	A9QM74	516 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BNC9	293 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638		H7C4K7	107 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TULP2	O00295	520 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIR	O00625	290 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCEA3	O75764	348 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSPG5	O95196	566 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	HLA-DRA	P01903	254 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ITGB1	P05556	798 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ODC1	P11926	461 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL4R	P24394	825 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRCC3	P46736	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLUD2	P49448	558 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNX16	P57768	344 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	LILRA4	P59901	499 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYL6	P60660	151 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRM2	Q14416	872 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	NCAPH	Q15003	741 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	IQCB1	Q15051	598 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAB2	Q15742	525 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	USP41	Q3LFD5	358 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	GBP6	Q6ZN66	633 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNX32	Q86XE0	403 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	VPS52	Q8N1B4	723 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35C1	Q96A29	364 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SENP8	Q96LD8	212 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	NT5C1B	Q96P26	610 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPAG5	Q96R06	1193 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	VPS16	Q9H269	839 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDST4	Q9H3R1	872 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	TLR9	Q9NR96	1032 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	MARCH5	Q9NX47	278 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB20	Q9NX57	234 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	DSE	Q9UL01	958 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ECHDC1-208	ENST00000436638	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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