RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1B2P21281 511 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1G1P47890 313 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MPP3Q13368 585 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C2CD6Q53TS8 623 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BNIPLQ7Z465 357 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MAML3Q96JK9 1138 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 E9PBE3 544 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL41O60662 606 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FCGR1AP12314 374 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP11B1P15538 503 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTFP26441 200 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM151AQ8WW52 585 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ELP3Q9H9T3 547 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR41Q9HAD4 459 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS18Q9NS28 235 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPAP49450 140 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TTI2Q6NXR4 508 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTL9Q8TC94 416 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 UBXN8O00124 270 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SGPL1O95470 568 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 IRF1P10914 325 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK1P28482 360 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH18Q13634 790 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPAQ15257 358 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNG2Q16589 344 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNTL6Q49A17 601 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CNPY3Q9BT09 278 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD54BQ9Y620 910 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GAT3O94766 335 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 UPP2O95045 317 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 VDRP11473 427 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TALDO1P37837 337 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC11A2P49281 568 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 AGKQ53H12 422 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TERB1Q8NA31 727 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 EXD1Q8NHP7 514 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SBF2Q86WG5 1849 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM24O15164 1050 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PROSCO94903 275 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A27O95847 323 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CSF1RP07333 972 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OOSP2Q86WS3 158 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RNFT2Q96EX2 444 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 APOL2Q9BQE5 337 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TM9SF1O15321 606 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 AP1G2O75843 785 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH1A3P47895 512 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF2Q12933 501 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RAET1EQ8TD07 263 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS33AQ96AX1 596 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms