RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK32AQ8WU08 396 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP2A3Q93084 1043 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHOX2BQ99453 314 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EBF3Q9H4W6 596 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLRC4Q9NPP4 1024 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHGC3Q9UN70 934 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.23■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KANSL1LA0AUZ9 987 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3R2O00459 728 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPHB6O15197 1021 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP11B1P15538 503 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AOC1P19801 751 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DAOAP59103 153 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUNX3Q13761 415 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PASD1Q8IV76 773 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPA6Q8N4T0 437 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTC8Q8TAM2 541 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRGQQ8WZA9 623 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA1Q92805 767 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOX5Q96PH1 765 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HPS4Q9NQG7 708 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.22■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1B0GTH6 734 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E2F8A0AVK6 867 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YJEFN3A6XGL0 299 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E7ENQ6 273 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SART1O43290 800 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFATC1O95644 943 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRF1P10914 325 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCF15Q12870 199 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDCLQ13371 301 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIB1Q86YT6 1006 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PJA1Q8NG27 643 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM3CQ92520 227 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXQ1Q9C009 403 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIS12Q9H081 205 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LHX5Q9H2C1 402 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPY26PQ9H489 355 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.21■□□□□ 0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MDM4O15151 490 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX33O43247 280 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GFPT2O94808 682 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARSAP15289 507 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD72P21854 359 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AVPR2P30518 371 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTHP32929 405 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX5P35711 763 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAT1P42224 750 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JAM2P57087 298 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMPD2Q01433 879 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFEMP1Q12805 493 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EML3Q32P44 896 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF139Q8WU17 664 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NELL2Q99435 816 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRRX2Q99811 253 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC4A5Q9BY07 1137 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYTH4Q9UIA0 394 aa18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E5RJQ4 531 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABBR2O75899 941 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX9P48436 509 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPN5P54829 565 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNX16P57768 344 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COG7P83436 770 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCCQ00597 558 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NR1H3Q13133 447 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAF3Q5VWG9 929 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM110Q86TL2 294 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.19■□□□□ 0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM35BQ8NCS4 154 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms