RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CFBP00751 764 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITGAVP06756 1048 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PATE4P0C8F1 98 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 JUPP14923 745 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF823P16415 610 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF12P17014 697 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TBPP20226 339 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MDKP21741 143 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APBA1Q02410 837 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLE1Q04724 770 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TDGQ13569 410 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BTBD8Q5XKL5 378 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SAXO2Q658L1 398 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BARGINQ6ZT62 677 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MED25Q71SY5 747 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLNKQ7Z7G1 428 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBFAQ8N0V3 343 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF182Q8N6D2 247 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POM121L12Q8N7R1 296 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HELQQ8TDG4 1101 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BCAS4Q8TDM0 211 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FKBP10Q96AY3 582 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BICD1Q96G01 975 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MKNK1Q9BUB5 465 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OSBPL6Q9BZF3 934 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD244Q9BZW8 370 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TASP1Q9H6P5 420 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CNNM2Q9H8M5 875 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGEF4Q9NR80 690 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MSRB1Q9NZV6 116 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BTBD7Q9P203 1132 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EPS15L1Q9UBC2 864 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GABBR1Q9UBS5 961 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EPHA6Q9UF33 1036 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF407Q9C0G0 2248 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INAFM1C9JVW0 142 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 F8W810 466 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAFGO15525 162 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VAMP4O75379 141 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCATO75600 419 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM13AO94988 1023 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TGDSO95455 350 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD72P21854 359 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GATA3P23771 443 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AXLP30530 894 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHRNB4P30926 498 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AMZ1Q400G9 498 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q5W150 140 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SASS6Q6UVJ0 657 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRSAM1Q6UWE0 723 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRC31Q6UY01 552 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CEACAM20Q6UY09 585 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AGMOQ6ZNB7 445 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DSELQ8IZU8 1212 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C11orf42Q8N5U0 333 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TERB1Q8NA31 727 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR5AN1Q8NGI8 311 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM200AQ8TCP9 573 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SORCS1Q8WY21 1168 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM190Q8WZ59 177 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CTHRC1Q96CG8 243 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DYDC2Q96IM9 177 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCRL5Q96RD9 977 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SOSTQ9BQB4 213 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FSD1LQ9BXM9 530 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CAPN10Q9HC96 672 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FGF22Q9HCT0 170 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP25Q9UHP3 1055 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SDK2Q58EX2 2172 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASTN1O14525 1302 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AATKQ6ZMQ8 1374 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAG1Q86YV5 1406 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM171A2A8MVW0 826 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CBFA2T2O43439 604 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KBTBD11O94819 623 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BRD1O95696 1058 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRTAMO95727 393 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MPIG6BO95866 241 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGHV3-13P01766 116 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-1.48□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms