RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 INTS13Q9NVM9 706 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DKK2Q9UBU2 259 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB21Q9UL25 225 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 NOX1Q9Y5S8 564 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 A6NLC8 198 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC38A8A6NNN8 435 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP4M1O00189 453 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP27B1O15528 508 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIAP1O43715 76 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR47O94967 919 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE8BO95263 885 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLP2RO95838 553 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBX18O95935 607 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKCBP05771 671 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSF1P09603 554 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYL1P12980 280 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FPR3P25089 353 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTGFP29279 349 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKAR1BP31321 381 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLA2G5P39877 138 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SELENOPP49908 381 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TIRAPP58753 221 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SATB1Q01826 763 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS6KA2Q15349 733 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 NRN1LQ496H8 165 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR16Q569H4 304 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF484Q5JVG2 852 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO47Q5MNV8 452 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD40Q6AI12 368 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAATS1Q7Z4T9 603 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf210Q8IVY1 113 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYNE4Q8N205 404 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEX19Q8NA77 164 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL17REQ8NFR9 667 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPPL3Q8TCT6 385 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLEC4CQ8WTT0 213 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMGB4Q8WW32 186 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HERVK_113Q902F9 699 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFAP2BQ92481 460 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HTRA1Q92743 480 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 EDAQ92838 391 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FKBP10Q96AY3 582 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLOD4Q9HC38 313 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDP2Q9P2J9 529 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 GJD2Q9UKL4 321 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS4AQ9UN37 437 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SALL3Q9BXA9 1300 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1B0GVC2 190 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRRT4C9JH25 899 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIRC3C9JPN6 131 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNX2O60749 519 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRAMEF2O60811 474 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM163BP0C2L3 166 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELFN1P0C7U0 828 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENGP17813 658 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPINA4P29622 427 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 THBS4P35443 961 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTHFSP49914 203 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 NR1H2P55055 460 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPP1Q00013 466 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 E2F1Q01094 437 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLP2Q04941 152 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACOX1Q15067 660 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TXNRD1Q16881 649 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE7PQ495Y7 208 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGFL4Q6B9Z1 124 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAIR1Q6GTX8 287 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 NFRKBQ6P4R8 1299 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTLL10Q6ZVT0 673 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 P3H2Q8IVL5 708 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC44A3Q8N4M1 653 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABHD5Q8WTS1 349 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 THAP4Q8WY91 577 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB3Q92617 1050 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms