RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 E7ESA3 106 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SMAPO00193 183 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 GABRDO14764 452 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 BEST1O76090 585 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ADIGQ0VDE8 80 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MTM1Q13496 603 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 C6orf89Q6UWU4 347 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 LPPQ93052 612 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ZNF487B1APH4 448 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RASA4BC9J798 803 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 KCNN4O15554 427 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RASA4O43374 803 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CYP2F1P24903 491 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SERINC5Q86VE9 423 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CCDC185Q8N715 623 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.8■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CA12O43570 354 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 FCGRTP55899 365 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 TRIM32Q13049 653 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 IFT88Q13099 833 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 PDIK1LQ8N165 341 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SPC25Q9HBM1 224 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MIOSQ9NXC5 875 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 NPR3P17342 541 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RBL1P28749 1068 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SSTR1P30872 391 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MATKP42679 507 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 FLT3LGP49771 235 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SLC8A3P57103 927 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ADCY1Q08828 1119 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 BBS9Q3SYG4 887 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 DEFB106AQ8N104 65 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RTP4Q96DX8 246 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SENP8Q96LD8 212 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CHST12Q9NRB3 414 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 KIAA0754O94854 1291 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 THP07101 528 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CLCNKBP51801 687 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 KCNJ11Q14654 390 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 STRADAQ7RTN6 431 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ZBED1O96006 694 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 FAM163BP0C2L3 166 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MGAT3Q09327 533 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 NR1H3Q13133 447 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 TRABD2AQ86V40 505 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 HACE1Q8IYU2 909 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 PAK5Q9P286 719 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CFAP69A5D8W1 941 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 ARL5CA6NH57 179 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SEPT4O43236 478 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CAPN15O75808 1086 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 PHBP35232 272 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 TM4SF4P48230 202 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CABS1Q96KC9 395 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 MED10Q9BTT4 135 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX18-201ENST00000326277 NDUFV1P49821 464 aa23.76■■□□□ 1.39
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