RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 VCLP18206 1134 aa23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIPP30301 263 aa23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAP1Q03518 808 aa23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.15■■□□□ 1.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 K7ERI5 159 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TXNDC9O14530 226 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PGM3O95394 542 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 BPGMP07738 259 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 UQCRBP14927 111 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP4Q13107 963 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 STX3Q13277 289 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 C16orf46Q6P387 395 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 JDP2Q8WYK2 163 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PROCP04070 461 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 OLFM3Q96PB7 478 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.14■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 H7C0C1 242 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP5OP48047 213 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBB3Q13509 450 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA24Q86W54 205 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL4Q9C0H6 718 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CREB3O43889 395 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD19P15391 556 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 AOC1P19801 751 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXL19Q6PCT2 694 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 AAGABQ6PD74 315 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATG14Q6ZNE5 492 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSPH3Q86UC2 560 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC28BQ9BUN5 200 aa23.13■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 INHBCP55103 352 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 EMC2Q15006 297 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIP10Q15642 601 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMEL1Q495T6 779 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB33Q86T24 672 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPXM1Q96SM3 734 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPAG6O75602 509 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 VAV1P15498 845 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 WASHC5Q12768 1159 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 STKLD1Q8NE28 680 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEBP4Q96S96 227 aa23.12■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMPSTE24O75844 475 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT34O76011 436 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 APRTP07741 180 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPINB6P35237 376 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TGFB2P61812 414 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 HPS6Q86YV9 775 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM130Q8N3G9 435 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNN4O15554 427 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDK3Q15120 406 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBCCQ15814 346 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEPTORQ8TB45 409 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM151AQ8WW52 585 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP29Q9HBJ7 922 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP18Q9UMW8 372 aa23.11■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATG7O95352 703 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNA4P22459 653 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAP1GAPP47736 663 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOMO1Q15155 1222 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPP5Q8N3R9 675 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTLL6Q8N841 843 aa23.1■■□□□ 1.29
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.293e-6■■■■□ 20.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 DTNBP1Q96EV8 351 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms