RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nudt8Q9CR24 210 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rec114Q9CWH4 259 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccr10Q9JL21 362 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5538W4VSP6 401 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RcvrnP34057 202 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sox8Q04886 464 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Etaa1Q5SVT3 877 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cox16Q9CR63 106 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10722F6VLK5 217 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde8aO88502 823 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurog2P70447 263 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GapdhsQ64467 440 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Got1l1Q7TSV6 404 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arfip2Q8K221 341 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pofut2Q8VHI3 429 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trem2Q99NH8 227 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arl8bQ9CQW2 186 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nsmce1Q9D720 266 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smok3aC0HKC8 504 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smok3bC0HKC9 504 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcb1bP06795 1276 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IppP28575 584 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TktP40142 623 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccr5P51682 354 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Capn3Q64691 821 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sp140Q6NSQ5 534 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem130Q6NXM3 419 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam49aQ8BHZ0 323 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grik4Q8BMF5 956 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AA792892Q8C6S1 278 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prpsap2Q8R574 369 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itgbl1Q8VDV0 494 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mettl7bQ9DD20 244 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r25W4VSP2 855 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4302E9PX25 294 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atf6F6VAN0 656 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtgisO35074 501 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbxas1P36423 533 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klf1P46099 358 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CblbQ3TTA7 982 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aldh1a2Q62148 518 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp62Q8C827 914 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hdhd5Q91WM2 419 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ror1Q9Z139 937 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnfrsf11bO08712 401 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp2f2P33267 491 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Msx3P70354 204 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xkr4Q5GH67 647 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exoc3l1Q8BI71 739 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Man2a2Q8BRK9 1152 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FktnQ8R507 461 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp64Q99KE8 643 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Oaz1P54369 227 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc138Q0VF22 680 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Togaram2Q3TYG6 1002 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prmt7Q922X9 692 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armc9Q9D2I5 817 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gabbr1Q9WV18 960 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DldO08749 509 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q3TQQ9 903 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tas2r109Q7M707 316 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc3Q91YW3 504 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ParvbQ9ES46 365 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ItpkcQ7TS72 678 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Alg9Q8VDI9 611 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf687Q9D2D7 1237 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6205E9PZS2 359 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fmo3P97501 534 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anapc5Q8BTZ4 740 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6367Q8C6L9 287 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Celf3Q8CIN6 465 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Angel2Q8K1C0 544 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Colgalt1Q8K297 617 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Alas1Q8VC19 642 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PdgfdQ925I7 370 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmed5Q9CXE7 229 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem68Q9D850 329 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lmo2P25801 158 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Faf2Q3TDN2 445 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gsto2Q8K2Q2 248 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zcchc18Q8VD24 393 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Oma1Q9D8H7 521 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ErmapQ9JLN5 566 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.8 ms