RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.685e-6■■■□□ 18.8
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CLN8-211ENST00000636934 PSMC4P43686 418 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 HUNKP57058 714 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 BASP1P80723 227 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 IL9RQ01113 521 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 CBLBQ13191 982 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD22Q5VYY1 191 aa19.3■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 TAF2Q6P1X5 1199 aa19.3■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 PLD5Q8N7P1 536 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 SMC6Q96SB8 1091 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 APBA2Q99767 749 aa19.3■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 ADORA2BP29275 332 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 LRRC14Q15048 493 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 EFHC1Q5JVL4 640 aa19.29■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 ANKMY2Q8IV38 441 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 TMEM40Q8WWA1 233 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 DPEP3Q9H4B8 488 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 TRABDQ9H4I3 376 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 KLK14Q9P0G3 267 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 IPPQ9Y573 584 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 TCP11X1B4DZS4 312 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 H0YHG0 523 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 ZBED1O96006 694 aa19.29■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 HIC1Q14526 733 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 NPNTQ6UXI9 565 aa19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 CCT8L1PA6NM43 557 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 M0QZ92 97 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 HDAC4P56524 1084 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 XRCC4Q13426 336 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 DPYSL2Q16555 572 aa19.28■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 FNBP1LQ5T0N5 605 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 FBXO36Q8NEA4 188 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 ACSS3Q9H6R3 686 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 CAPN7Q9Y6W3 813 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 CLUHO75153 1309 aa19.28■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 LCP1P13796 627 aa19.27■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 NR2C2P49116 596 aa19.27■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 KCNJ11Q14654 390 aa19.27■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa19.27■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
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CLN8-211ENST00000636934 SLC38A7Q9NVC3 462 aa19.27■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa19.27■□□□□ 0.68
CLN8-211ENST00000636934 SPTLC1O15269 473 aa19.27■□□□□ 0.67
CLN8-211ENST00000636934 KCNN4O15554 427 aa19.27■□□□□ 0.67
CLN8-211ENST00000636934 SNX3O60493 162 aa19.27■□□□□ 0.67
CLN8-211ENST00000636934 GABBR2O75899 941 aa19.27■□□□□ 0.67
CLN8-211ENST00000636934 SUN1O94901 812 aa19.27■□□□□ 0.67
CLN8-211ENST00000636934 AKR1A1P14550 325 aa19.27■□□□□ 0.67
CLN8-211ENST00000636934 BEX3Q00994 111 aa19.27■□□□□ 0.67
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