RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D14Q9P2M4 693 aa13.79□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PILRBQ9UKJ0 227 aa13.79□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 MTMR6Q9Y217 621 aa13.79□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 FAM163BP0C2L3 166 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 GABRG2P18507 467 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 WASP42768 502 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 CASP4P49662 377 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PGFP49763 221 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 CDH8P55286 799 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 ASIC1P78348 528 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 GAD2Q05329 585 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PIP4P1Q86T03 277 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 FAM35AQ86V20 835 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 TMEM25Q86YD3 366 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PGBD3Q8N328 593 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 DEFB119Q8N690 84 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 GMIPQ9P107 970 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 PTPRBP23467 1997 aa13.78□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 BPTFQ12830 3046 aa13.77□□□□□ -0.2
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 MAST4O15021 2626 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CFIP05156 583 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 IRF1P10914 325 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CASP1P29466 404 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SLC5A3P53794 718 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 EHHADHQ08426 723 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SEMA3BQ13214 749 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 HECTD3Q5T447 861 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 TERB1Q8NA31 727 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 DHX58Q96C10 678 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 OTUB2Q96DC9 234 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SDCBP2Q9H190 292 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 IL37Q9NZH6 218 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 DEC1Q9P2X7 70 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 KLK13Q9UKR3 277 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.77□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CKAP5Q14008 2032 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 UBE4BO95155 1302 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PQF6 199 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 HOXB2P14652 356 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 TUBP50607 506 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 FAM193AP78312 1265 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 TRPC3Q13507 836 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 STK38Q15208 465 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ANO4Q32M45 955 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 FUKQ8N0W3 1084 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ACOX2Q99424 681 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 MED10Q9BTT4 135 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CAPN10Q9HC96 672 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CD248Q9HCU0 757 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 CD93Q9NPY3 652 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 KRT82Q9NSB4 513 aa13.76□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ATP8B3O60423 1300 aa13.75□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 ADAMTS20P59510 1910 aa13.75□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa13.75□□□□□ -0.21
FCHO1-220ENST00000597474 FAM92AA1XBS5 289 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms