RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 MARCH5Q9NX47 278 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 COL6A3P12111 3177 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF487B1APH4 448 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MDM4O15151 490 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 B4GALT3O60512 393 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 LTFP02788 710 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SULT1E1P49888 294 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP11AP98196 1134 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR17Q13304 367 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNG2Q16589 344 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CDO1Q16878 200 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF21Q96ID5 467 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC19Q9H756 370 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SPG21Q9NZD8 308 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP8B1O43520 1251 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT17Q04695 432 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCY1Q08828 1119 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF6Q58WW2 860 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR65Q8IYL9 337 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB106AQ8N104 65 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC9A7Q96T83 725 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ACBD3Q9H3P7 528 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 LTBP2Q14767 1821 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBBXA8MT70 800 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DLL1O00548 723 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 BEST1O76090 585 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ECEL1O95672 775 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KDELR1P24390 212 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.62■■□□□ 1.37
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CAPNS1-212ENST00000591041 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPH1Q92598 858 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CWH43Q9H720 699 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MAFFQ9ULX9 164 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 F8W810 466 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RARAP10276 462 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CDH6P55285 790 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GUCY2DQ02846 1103 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DEUP1Q05D60 604 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP93Q8N1F7 819 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PRELID2Q8N945 189 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ATL2Q8NHH9 583 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNK16Q96T55 309 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CALN1Q9BXU9 219 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 HHLA1C9JL84 531 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD51CO43502 376 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SOD2P04179 222 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L7P0C7H9 530 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAM1P13591 858 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CDKN2BP42772 138 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PSEN1P49768 467 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R7Q15435 360 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF5Q15542 800 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMD5Q16401 504 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KAZNQ674X7 775 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.6■■□□□ 1.37
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