RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 EXOC4Q96A65 974 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 IER2Q9BTL4 223 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF38Q9H0F5 515 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NCDNQ9UBB6 729 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 BICDL2A1A5D9 508 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF40O75150 1001 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CD19P15391 556 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FNTBP49356 437 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SEC13P55735 322 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC7A9P82251 487 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ZXDBP98169 803 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ENPEPQ07075 957 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CCINQ13939 588 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA20Q8TB22 786 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CD101Q93033 1021 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CISHQ9NSE2 258 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB23Q9ULC3 237 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TNFRSF10BO14763 440 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TLR5O60602 858 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PFKLP17858 780 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R2P41236 205 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 GALK1P51570 392 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 NRLP54845 237 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2HP62256 183 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KDSRQ06136 332 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DMWDQ09019 674 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PAK1Q13153 545 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DCLK2Q8N568 766 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 WHAMMQ8TF30 809 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 OVCA2Q8WZ82 227 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 NAGPAQ9UK23 515 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 USP34Q70CQ2 3546 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PQH9 124 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MDM4O15151 490 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 OLFM2O95897 454 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ADH1CP00326 375 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP17A1P05093 508 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 DRD1P21728 446 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXC13P31276 330 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FMO5P49326 533 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PGFP49763 221 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 RAD23BP54727 409 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC8A3P57103 927 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CUL2Q13617 745 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 MORC3Q14149 939 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TTI2Q6NXR4 508 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP68Q76N32 757 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC30AQ86WT1 665 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC39CQ8N584 583 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms