RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569304.1

RAB11A-208, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB11A, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	EYA2	O00167	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PROM1	O43490	865 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	SPDEF	O95238	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PRKCB	P05771	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PDHA1	P08559	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	LAG3	P18627	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PRKAA2	P54646	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	ITIH3	Q06033	890 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CUL4B	Q13620	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TAF12	Q16514	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	LNX2	Q8N448	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	LPIN2	Q92539	896 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	VPS16	Q9H269	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304		H0Y3Z8	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	MUSK	O15146	869 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	LPXN	O60711	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TK1	P04183	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CDK7	P50613	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	NXPH1	P58417	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	MTAP	Q13126	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	GLG1	Q92896	1179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	EXTL1	Q92935	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB11A-208	ENST00000569304	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304		A1L4Q6	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TISP43	B9A030	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304		K7ESM1	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	EXOC5	O00471	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	WDR47	O94967	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	VNN1	O95497	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	JUP	P14923	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CD19	P15391	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	AKT1	P31749	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DDIT3	P35638	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SEC24C	P53992	1094 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ACTR2	P61160	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CSHL1	Q14406	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	NFIX	Q14938	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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