RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279		E5RJQ4	531 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TULP2	O00295	520 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SPTLC1	O15269	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HCRT	O43612	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LIAS	O43766	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TJP3	O95049	919 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TRNP1	Q6NT89	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	UNC93A	Q86WB7	457 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC43	Q8N309	656 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SNF8	Q96H20	258 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ZWILCH	Q9H900	591 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PIK3R2	O00459	728 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HOXA2	O43364	376 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KRT7	P08729	469 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	NUDT17	P0C025	328 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ITIH2	P19823	946 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RGS7	P49802	495 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RAB30	Q15771	203 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TAZ	Q16635	292 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ITGB1	P05556	798 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TH	P07101	528 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ATF2	P15336	505 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GPD1	P21695	349 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KLRC2	P26717	231 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	MIP	P30301	263 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CTNNB1	P35222	781 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PNPLA4	P41247	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	OR1G1	P47890	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SLC11A1	P49279	550 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	BCAR1	P56945	870 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SKOR1	P84550	965 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ACAP1	Q15027	740 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PMF1	Q6P1K2	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	MIS12	Q9H081	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TRANK1	O15050	2925 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279		A8MXQ7	604 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GABBR2	O75899	941 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SHBG	P04278	402 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RARG	P13631	454 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	VPS41	P49754	854 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TAF6	P49848	677 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CLCNKB	P51801	687 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ITGA8	P53708	1063 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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