RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CLIC1	O00299	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	THBS4	P35443	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	KCNB1	Q14721	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	EXOC5	O00471	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MAML1	Q92585	1016 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MARCH6	O60337	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TULP3	O75386	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC7A1	P30825	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	GATM	P50440	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HSF1	Q00613	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	STIM1	Q13586	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	NPY5R	Q15761	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397		B4DGG1	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397		H7C4K7	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TBX3	O15119	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CCP110	O43303	1012 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TOMM40	O96008	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HGF	P14210	728 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CD19	P15391	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MCM5	P33992	734 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CPA2	P48052	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HTR6	P50406	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	YPEL5	P62699	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	USP19	O94966	1318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TUSC2	O75896	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	RASSF9	O75901	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PGD	P52209	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ITGA8	P53708	1063 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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