RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555916.1

AC005480.1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC005480.1, Length 3,548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005480.1-202ENST00000555916 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 FAM13CQ8NE31 585 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ART4Q93070 314 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 CCDC77Q9BR77 488 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 GPR88Q9GZN0 384 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 H0YCG3 227 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 M0QZ92 97 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 UNC5CO95185 931 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TTC4O95801 387 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 GAS8O95995 478 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ETS1P14921 441 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ATP5DP30049 168 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ABCD1P33897 745 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 CDC42EP1Q00587 391 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RCN2Q14257 317 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TEKT4Q8WW24 435 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PPT2Q9UMR5 302 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 CHKBQ9Y259 395 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 USP20Q9Y2K6 914 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 NCANO14594 1321 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF286BP0CG31 522 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RALAP11233 206 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KRT10P13645 584 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PLS3P13797 630 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ALDH3A1P30838 453 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 NKX3-2P78367 333 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 BLMHQ13867 455 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TFDP1Q14186 410 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KCNA10Q16322 511 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ANO7Q6IWH7 933 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 NELL1Q92832 810 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ZNF333Q96JL9 665 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 CYTH2Q99418 400 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 SYT15Q9BQS2 421 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KAT6AQ92794 2004 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PCNTO95613 3336 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 LCTP09848 1927 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 NRCAMQ92823 1304 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 MAPK13O15264 365 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ASGR1P07306 291 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PIK3CAP42336 1068 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 MXI1P50539 228 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 PEX5P50542 639 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 P3H1Q32P28 736 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 VPS52Q8N1B4 723 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 KIFAP3Q92845 792 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 SKA1Q96BD8 255 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 IFT43Q96FT9 208 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 SNF8Q96H20 258 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 TRABDQ9H4I3 376 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.55□□□□□ -1.36
AC005480.1-202ENST00000555916 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms