RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE4B	O95155	1302 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM24	O15164	1050 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SPTLC2	O15270	562 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	MAP3K13	O43283	966 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TULP3	O75386	442 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ENG	P17813	658 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPK8	P45983	427 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PGF	P49763	221 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC5A3	P53794	718 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	GAD2	Q05329	585 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TRPC3	Q13507	836 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	GMIP	Q9P107	970 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	LAMA5	O15230	3695 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	STX6	O43752	255 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP6R2	O75170	966 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	IRF1	P10914	325 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRG2	P18507	467 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ITPKA	P23677	461 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ATIC	P31939	592 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	AMPD3	Q01432	767 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	LMAN2	Q12907	356 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PGBD3	Q8N328	593 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	GATA6	Q92908	595 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LETMD1-231	ENST00000551931	PTPRB	P23467	1997 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	PHACTR2	O75167	634 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	BEST1	O76090	585 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	WAS	P42768	502 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	TUB	P50607	506 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	ORC1	Q13415	861 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	BIRC3	Q13489	604 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	ANO4	Q32M45	955 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	DEFB119	Q8N690	84 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	TERB1	Q8NA31	727 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.33	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	KNL1	Q8NG31	2342 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PQF6	199 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
LETMD1-231	ENST00000551931	GREM1	O60565	184 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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