RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 ATP2A3Q93084 1043 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GBP4Q96PP9 640 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CYLDQ9NQC7 956 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TDGF1P13385 188 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CD19P15391 556 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ZNF132P52740 706 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 APBA1Q02410 837 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GCNT1Q02742 428 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PDE4CQ08493 712 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CETN1Q12798 172 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 SGO2Q562F6 1265 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 RAB41Q5JT25 222 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 FBXO4Q9UKT5 387 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 FAM186AA6NE01 2351 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CFAP54Q96N23 3096 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 MDM4O15151 490 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GREM1O60565 184 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CYP17A1P05093 508 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 VDRP11473 427 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GALK1P51570 392 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 SATB1Q01826 763 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 LRRC32Q14392 662 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PKDCCQ504Y2 493 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 UBA3Q8TBC4 463 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 MYH10P35580 1976 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 EGFP01133 1207 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PAEPP09466 180 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 HOXC13P31276 330 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 BCAT1P54687 386 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GJB7Q6PEY0 223 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 NELL1Q92832 810 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 E2F8A0AVK6 867 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GABBR2O75899 941 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 NFATC1O95644 943 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 IRF1P10914 325 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 RARGP13631 454 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 OPRD1P41143 372 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 DHCR24Q15392 516 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 IER2Q9BTL4 223 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 THAP9Q9H5L6 903 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 NAGPAQ9UK23 515 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PRR23AA6NEV1 266 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 SLC9A1P19634 815 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TKTL1P51854 596 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 MESP2Q0VG99 397 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 NACA2Q9H009 215 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 ZNF292O60281 2723 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 GFRA3O60609 400 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PLA2G4AP47712 749 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-222ENST00000550996 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms