RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 CETN1Q12798 172 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RUBCNQ92622 972 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 NELL1Q92832 810 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 WBP2Q969T9 261 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 NT5C1BQ96P26 610 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 NMUR1Q9HB89 426 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 OSER1Q9NX31 292 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TBC1D14Q9P2M4 693 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa15.25■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 E2F8A0AVK6 867 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 LILRB5O75023 590 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ADH5P11766 374 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 OPRD1P41143 372 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KIF11P52732 1056 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KDSRQ06136 332 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ANO4Q32M45 955 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SGO2Q562F6 1265 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CEP68Q76N32 757 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PIGZQ86VD9 579 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 LONP2Q86WA8 852 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 NAT16Q8N8M0 369 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 UBA3Q8TBC4 463 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 EPC1Q9H2F5 836 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 HESX1Q9UBX0 185 aa15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 OBSL1O75147 1896 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 GNA14O95837 355 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RALAP11233 206 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 FBXO43Q4G163 708 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 C2orf27AQ580R0 203 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM270Q6UE05 265 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RRAGAQ7L523 313 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TTC30AQ86WT1 665 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 MIB1Q86YT6 1006 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KAT5Q92993 513 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 HHIPQ96QV1 700 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PNKPQ96T60 521 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 USP34Q70CQ2 3546 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PTPRDP23468 1912 aa15.23■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PATJQ8NI35 1801 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ANTXRLA6NF34 631 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TULP2O00295 520 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 HRO43593 1189 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 HMBSP08397 361 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC192P0DO97 292 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 VDRP11473 427 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TKTL1P51854 596 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 GAD2Q05329 585 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PDE4CQ08493 712 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KCNH2Q12809 1159 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 GAB4Q2WGN9 574 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SCD5Q86SK9 330 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 C12orf40Q86WS4 652 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CYLDQ9NQC7 956 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 DMDP11532 3685 aa15.22■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 K7EQS6 105 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CALCAP01258 141 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 APODP05090 189 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PLA2G4AP47712 749 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms