RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	TP73	O15350	636 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	B4GALT5	O43286	388 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CP	P00450	1065 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	AKR1A1	P14550	325 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SMPD1	P17405	629 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	ARSE	P51690	589 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RABGGTB	P53611	331 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	IGBP1	P78318	339 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX1	Q13596	522 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SV2C	Q496J9	727 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SEZ6	Q53EL9	994 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PDIK1L	Q8N165	341 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	RAPGEF5	Q92565	580 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KIF12	Q96FN5	646 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CABS1	Q96KC9	395 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM7	Q9C029	511 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	USP18	Q9UMW8	372 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-223	ENST00000550442	TRANK1	O15050	2925 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	TLDC2	A0PJX2	215 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	HAS3	O00219	553 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR32	O75388	356 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM155B	O75949	473 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CFH	P08603	1231 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	PDGFRA	P16234	1089 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	SDC4	P31431	198 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	BCAT1	P54687	386 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	P3H1	Q32P28	736 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	PKDCC	Q504Y2	493 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC25	Q86WR0	208 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	GJD3	Q8N144	294 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CPXM1	Q96SM3	734 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF670	Q9BS34	389 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	AAAS	Q9NRG9	546 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	PAK5	Q9P286	719 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	RAD54B	Q9Y620	910 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442		E7ESA3	106 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	SGK1	O00141	431 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	RFXAP	O00287	272 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	PIR	O00625	290 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CHAD	O15335	359 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CST8	O60676	142 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAMTS4	O75173	837 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	FSBP	O95073	299 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTA1	P08263	222 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	MYOG	P15173	224 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	NDST1	P52848	882 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	OSTN	P61366	133 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	NKX3-2	P78367	333 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAM17	P78536	824 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK16	Q00536	496 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	IL9R	Q01113	521 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	GPS1	Q13098	491 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	HIF1A	Q16665	826 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF394	Q53GI3	561 aa		12.32	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms