RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 EXOC4Q96A65 974 aa8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MISP3Q96FF7 219 aa8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LRRC3Q9BY71 257 aa8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 YIPF1Q9Y548 306 aa8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 COL4A2P08572 1712 aa8.32□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 E9PMD0 336 aa8.31□□□□□ -1.08
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C16orf62-212ENST00000540240 SLC16A4O15374 487 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 JAK2O60674 1132 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ICMTO60725 284 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 AKAP3O75969 853 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CLTAP09496 248 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF806P0C7X5 589 aa8.31□□□□□ -1.08
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C16orf62-212ENST00000540240 GUCY2CP25092 1073 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 NEK4P51957 841 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MCL1Q07820 350 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SMARCB1Q12824 385 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DUSP4Q13115 394 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CENPPQ6IPU0 288 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TMC8Q8IU68 726 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CD302Q8IX05 232 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DAW1Q8N136 415 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GAB3Q8WWW8 586 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 FAM168AQ92567 244 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PSMG2Q969U7 264 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TASP1Q9H6P5 420 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 KCND2Q9NZV8 630 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.31□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TTC26A0AVF1 554 aa8.3□□□□□ -1.08
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C16orf62-212ENST00000540240 ODC1P11926 461 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PLS3P13797 630 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GABRR2P28476 465 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CDC25CP30307 473 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PRPHP41219 470 aa8.3□□□□□ -1.08
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C16orf62-212ENST00000540240 SHC2P98077 582 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GUCY1B3Q02153 619 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ID3Q02535 119 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DMWDQ09019 674 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MAPK7Q13164 816 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 VEPH1Q14D04 833 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PON2Q15165 354 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ZBTB6Q15916 424 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TAF12Q16514 161 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GPR158Q5T848 1215 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GCNAQ96QF7 691 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM209Q96SK2 561 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 DSEQ9UL01 958 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 TRIP11Q15643 1979 aa8.3□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CACNA1AO00555 2505 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 MTMR11A4FU01 709 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 EPN2O95208 641 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 VNN2O95498 520 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 ADRB2P07550 413 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 OR4Q2P0C623 313 aa8.29□□□□□ -1.08
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC192P0DO97 292 aa8.29□□□□□ -1.08
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